Первые матчи - 4 апреля. Ответные матчи - 18 апреля.

ЗЕНИТ (С.Петербург) - СПАРТАК (Москва) - 1:2

ДИНАМО (Москва) - ЛОКОМОТИВ (Москва) - 1:0
МОСКВА (Москва) - КРЫЛЬЯ СОВЕТОВ (Самара) - 3:2

РОСТОВ (Ростов-на-Дону) - ДИНАМО (Брянск) - 1:2

1/8 ФИНАЛА:

Первые матчи - 18 февраля, 4 марта. Ответные матчи - 26 февраля, 14 марта.

РОСТОВ (Ростов-на-Дону) - РУБИН (Казань) - 3:1, 1:0

ТОРПЕДО (Москва) - ДИНАМО (Брянск) - 0:1, 0:0
ЦСКА (Москва) - КРЫЛЬЯ СОВЕТОВ (Самара) - 0:0, 0:2

МОСКВА (Москва) - АМКАР (Пермь) - 3:0, 3:2
ДИНАМО (Москва) - ТОМЬ (Томск) - 2:0, 0:1

СПАРТАК (Москва) - СИБИРЬ (Новосибирск) - 1:0, 3:1

ЗЕНИТ (С.Петербург) - САТУРН (Раменское) - 1:0, 1:1

Московский "Локомотив" вышел в 1/4 финала Кубка России без игры, так как его соперник махачкалинское "Динамо" было снято из розыгрыша после лишения профессионального статуса.

1/16 ФИНАЛА:

Первые матчи - 2 июля. Ответные матчи - 20 сентября.

ЗЕНИТ-2 (С.Петербург) - РУБИН (Казань) - 0:3, 0:2

ХИМКИ (Химки) - РОСТОВ (Ростов-на-Дону) - 0:2, 1:0
ФАКЕЛ (Воронеж) - ТОРПЕДО (Москва) - 0:0, 1:3

ДИНАМО (Брянск) - ШИННИК (Ярославль) - 2:0, 1:3
ЦСКА (Москва) - МОРДОВИЯ (Саранск) - 4:0, 0:1
КРЫЛЬЯ СОВЕТОВ (Самара) - КУБАНЬ (Краснодар) - 1:1, 4:1

ТЕРЕК (Грозный) - ФК МОСКВА (Москва) - 4:1, 0:4

АМКАР (Пермь) - АНГУШТ (Назрань) - 3:0, 2:1

ЛОКОМОТИВ (Москва) - АНЖИ (Махачкала) - 4:2, 1:1

ДИНАМО (Махачкала) - ЛУЧ-ЭНЕРГИЯ (Владивосток) - 4:0, 0:3
СПАРТАК (Нижний Новгород) - ДИНАМО (Москва) - 1:3, 0:2
ДИНАМО (Киров) - ТОМЬ (Томск) - 0:4, 1:2
УРАЛ (Екатеринбург) - СПАРТАК (Москва) - 0:1, 2:2
СПАРТАК (Нальчик) - СИБИРЬ (Новосибирск) - 1:1, 0:2

ЧИТА (Чита) - ЗЕНИТ (С.Петербург) - 1:2, 1:2
САТУРН (Раменское) - МЕТАЛЛУРГ (Красноярск) - 4:1, 2:1